1、納稅人(rén)超過應納稅額繳納的(de)稅款，納稅人(rén)自結算(suàn)繳納稅款之日起三年内發現的(de)，可(kě)以向稅務機關要求退還(hái)多(duō)繳的(de)稅款并加算(suàn)銀行同期存款利息，稅務機關及時(shí)查實後應當立即退還(hái)。
2、納稅人(rén)在項目完成清算(suàn)後繼續支付并取得(de)合法、有效憑證的(de)成本和(hé)費用(yòng)，主管稅務機關可(kě)根據實際情況重新調整扣除項目金額，但該調整應在項目全部銷售完畢後進行。
3、主管稅務機關出具土地增值稅清算(suàn)稅款結論後，開發企業有下(xià)列情形之一的(de)，需按規定向主管稅務機關進行申報，經主管稅務機關審核屬實的(de)，補充和(hé)完善稅務機關清算(suàn)結論，并按規定辦理(lǐ)稅款繳納或退還(hái)手續：
（1）已清算(suàn)完畢的(de)開發項目又發生成本、費用(yòng)的(de)；
（2）納稅人(rén)取得(de)清算(suàn)時(shí)尚未取得(de)的(de)扣除項目相關憑證的(de)；
（3）主管稅務機關認爲應調整清算(suàn)結論的(de)其他(tā)情況。
4、納稅人(rén)在項目完成清算(suàn)後繼續支付并取得(de)合法有效憑證的(de)成本和(hé)費用(yòng)，主管稅務機關可(kě)根據實際情況重新調整扣除項目金額，但原則上應在項目全部銷售完畢時(shí)進行調整。
5、對(duì)于成片開發分(fēn)期清算(suàn)項目的(de)公共配套設施費用(yòng)，在先期清算(suàn)時(shí)應按實際發生的(de)費用(yòng)進行分(fēn)攤。對(duì)于後期清算(suàn)時(shí)實際支付的(de)公共配套設施費用(yòng)分(fēn)攤比例大(dà)于前期的(de)金額時(shí)，允許在整體項目全部清算(suàn)時(shí)，按照(zhào)整體項目重新進行調整分(fēn)攤。
6、清算(suàn)時(shí)因未取得(de)合法有效憑證，而未能認定的(de)成本項目(簡稱未定成本項目)，清算(suàn)後取得(de)合法有效憑證的(de)，應分(fēn)房(fáng)産類型歸集"後續成本額"，可(kě)在計算(suàn)當期清算(suàn)後轉讓房(fáng)産應納稅額時(shí)後續扣除，公式如下(xià)：
（1）單位建築面積成本費用(yòng)額=清算(suàn)認定(或上期累計)"單位建築面積成本費用(yòng)額"+本期"後續成本額"÷清算(suàn)可(kě)售建築面積
（2）清算(suàn)後轉讓扣除額=單位建築面積成本費用(yòng)額×本期轉讓面積+本期轉讓房(fáng)産有關稅金及附加
納稅人(rén)在清算(suàn)申報時(shí)應對(duì)"未定成本項目"進行附加說明(míng)，主管稅務機關在清算(suàn)審核時(shí)一并核實确認，否則相關成本不予以後續扣除。
來(lái)源：中國會計網